Výpočetní servery FLEX
Jak získám přístup
- zaměstnanci - automaticky
- studenti doktorského studia - automaticky
- studenti magisterského a bakalářského programu - po složení testu:
- složte test na adrese ssl.fs.cvut.cz/utp/12375/SERV-CZCZ pro úspěšné složení testu pečlivě přečtěte tuto stránku a odkazy (ověřuje se znalost serverů, pravidel, prostředí a základní příkazy)
- po složení testu se do 30 minut stanete členy skupiny fs-APP-Flex (viz DUPS) a můžete používat servery
- externí pracovníci - pouze původní uživatelé Flexe
Jaký je hardware a software
- flex.fsid.cvut.cz (HPE Superdome)
- 20 18-jádrových procesorů Intel Xeon Gold 3,0 GHz + 3898 GB RAM + diskové pole 15,6 TB
- Grafická karta pro vzdálenou vizualizaci OpenGL
- operační systém SLES
- programy ANSYS (různé verze), STAR-CCM, OpenFOAM, Mathematica, Matlab, Maple, Julia, Abaqus
- překladače Intel 2019, 2020
- systém souběžně podporuje programovací prostředí MPI a OpenMP
- ferretgpu.fsid.cvut.cz (HPE ProLiant DL380 Gen10)
- 2 12-jádrové procesory Intel Xeon Gold 2,6 GHz + 188 GB RAM + diskové pole 8 TB
- 2x grafická karta Tesla V100-PCIE-32GB pro testování výpočtů s akcelerací
- operační systém SLES
- programy ANSYS, Matlab, Maple, Mathematica, Cuda-11.6
Jak se používá
- Každý uživatel počítačů HPE je povinen dodržovat Pravidla ČVUT a Pravidla FS.
Servery jsou určeny pro výpočty, nikoli jiné aplikace, pro síťové služby (pošta, internet) apod. - Servery jsou dostupné na výše uvedených adresách (např. flex.fsid.cvut.cz) v síti ČVUT, mimo síť ČVUT využijte VPN.
- Přihlásíte se standardně pomocí ssh, hlavním jménem a heslem ČVUT.
Pro přenos souborů využijte scp/sftp (více informací o SSH najdete v FS#479). - OS serverů je Linux, je dobré umět alespoň některé základní příkazy,
nastudujete na Wikipedii nebo stránkách distribucí, nebo kdekoli jinde. - Váš lokální domovský adresář je přístupný v /home/SERVER/CVUT_LOGIN
Například /home/flex/novakjan, nikoli /home/novakjan. - Pro uživatele z FS jsou přístupné taktéž jejich domovské adresáře v /home/fsh/CVUT_LOGIN
- Rozsáhlé a časté mezivýsledky vašich úloh ukládejte zásadně jen na /scratch, nikam jinam!
Pokud nevíte nic o scratchích přečtěte si FS#480. - Úlohy spouštějte pomocí PBS (jak funguje PBS je popsáno v FS#478).
Vzor skriptu si můžete eventuálně stáhnout z /storage/PBS_template.
Pro připomenutí tam je i PBS skript pro interaktivní spuštění úlohy. - Standardní omezení celkového počtu jader na uživatele je 36 jader, jinak po domluvě.
Společné zásadní otázky a odpovědi k výpočtovým serverům
- Jak spustím na výpočetních serverech program ANSYS, Fluent, a jiné? (FS#330)
- Jak spustit program MATLAB na výpočetních serverech (FS#331)
- Jak spustit program Abaqus na výpočetních serverech (FS#329)
- Jak spouštět výpočty v programu Fluent na systému Flex (FS#486)
- Jak spustit výpočet v programu Fluent na pozadí na výpočetních serverech EL (FS#332)
- Co to je scratch? (FS#480)
- Jak použít protokol SSH pro přihlášení a přenos souborů (FS#479)
- Jak použít PBS (Portable Batch System) na výpočetních serverech (FS#478)
- Jak se připojit na výpočetní server pomocí NX (OpenNX) klienta (FS#352)
- Jak se mohu připojit k výpočetním serverům pomocí X2Go aplikace (FS#440)